Stammdaten wie Kostenstellen, Konten, Projekte und weitere Informationen, welche z.B. für die Kontierung benötigt werden, können von InvoiceR direkt aus Abacus geladen werden. Ebenfalls ermöglicht die Integration eine automatische Verbuchung der Rechnungen in Abacus und das Starten des Zahlungslaufs.

Neben dem ECM-System kann auch ein Dokumenten-Management-System wie z.B. docuvita an InvoiceR angebunden werden. Nach dem Scanning durch InvoiceR wird das PDF direkt in docuvita abgelegt. Beim Öffnen eines Belegs im InvoiceR wird nun automatisch das entsprechende Dokument aus dem Archiv geladen und dem Benutzer angezeigt.