InvoiceR kann auch sehr gut in Ihr Buchhaltungs-System (wie z.B. KLARA) integriert werden. Diese Anbindung erlaubt InvoiceR einen direkten Zugriff auf Ihre Stammdaten wie Kostenstellen, Konten, Projekte und weitere Informationen. Das Kontieren der Rechnungen wird dadurch im InvoiceR erheblich vereinfacht und es können Folgefehler vermieden werden. Ausserdem erfolgt die eigentliche Zahlungsfreigabe am Ende des Workflows automatisch in das Buchhaltungs-System.