Neben der Archiv-Schnittstelle kann invoiceR auch direkt an Ihr Buchhaltungs-System (wie z.B. Lobos) angebunden werden. Diese Anbindung erlaubt InvoiceR einen direkten Zugriff auf Ihre Daten wie Kostenstellen, Konten, Projekte und weitere Informationen. Das Kontieren der Rechnungen wird dadurch im InvoiceR erheblich vereinfacht und es können Folgefehler vermieden werden. Ausserdem erfolgt die eigentliche Zahlungsfreigabe am Ende des Workflows automatisch in das Buchhaltungs-System.