Die Anbindung an sage erlaubt InvoiceR einen direkten Zugriff auf Daten wie Kostenstellen, Konten, Projekte und weitere Informationen. Das Kontieren der Rechnungen wird dadurch im InvoiceR erheblich vereinfacht und Folgefehler werden vermieden. Ebenfalls ermöglicht die Integration eine automatische Verbuchung der Rechnungen in sage und das Starten des Zahlungslaufs.

Neben dem ECM-System kann auch ein Dokumenten-Management-System wie z.B. d.3ecm an InvoiceR angebunden werden. Dadurch werden Rechnungen nach dem Scanning durch InvoiceR direkt in d.3ecm archiviert. Im weiteren Workflow-Verlauf wird das Dokument beim Öffnen im InvoiceR jeweils automatisch aus dem Archiv bezogen und dem Benutzer angezeigt.