Neben der Archiv-Schnittstelle wird invoiceR auch direkt an Ihr Buchhaltungs-System (wie z.B. SAP) angebunden. Diese Anbindung erlaubt InvoiceR einen direkten Zugriff auf Ihre Daten wie Kostenstellen, Konten, Projekte und weitere Informationen. Das Kontieren der Rechnungen wird dadurch im InvoiceR erheblich vereinfacht und es können Folgefehler vermieden werden. Die Integration ermöglicht ausserdem eine automatische Verbuchung der Rechnungen in SAP und das anschliessende Starten des Zahlungslaufs.