Die Anbindung an Opale erlaubt InvoiceR einen direkten Zugriff auf Stammdaten wie Kostenstellen, Konten, Projekte und weitere Informationen. Das Kontieren der Rechnungen wird dadurch im InvoiceR erheblich vereinfacht und Folgefehler werden vermieden. Die Integration ermöglicht ausserdem eine automatische Verbuchung der Rechnungen in Opale und das anschliessende Starten des Zahlungslaufs.

Neben dem Buchhaltungs-System kann auch ein Dokumenten-Management-System wie z.B. docuvita an InvoiceR angebunden werden. Nach der Erfassung durch InvoiceR wird das Dokument direkt in docuvita archiviert. Beim Öffnen eines Belegs im InvoiceR wird nun automatisch das entsprechende Dokument aus dem Archiv geladen und dem Benutzer präsentiert.