Ihr Buchhaltungs-System (wie z.B. SAP) kann ebenfalls direkt an InvoiceR angebunden werden. Stammdaten wie Kostenstellen, Konten, Projekte und weitere Informationen, welche z.B. für die Kontierung benötigt werden, können von InvoiceR dann direkt aus SAP geladen werden. Ebenfalls ermöglicht die Integration eine automatische Verbuchung der Rechnungen in SAP und das Starten des Zahlungslaufs.